[MARMAM] New whale species publication

Emma Carroll e.carroll at auckland.ac.nz
Wed Oct 27 15:15:26 PDT 2021


Kia ora koutou - Hello everyone,

My co-authors and I are excited to share our new open-access
publication in *Proceedings
B* describing a new whale species, Ramari's beaked whale:

Speciation in the deep: genomics and morphology reveal a new species of
beaked whale *Mesoplodon eueu*

Available at: https://royalsocietypublishing.org/doi/10.1098/rspb.2021.1213

and with Spanish and Portuguese abstracts on ResearchGate:
https://www.researchgate.net/publication/355653095_Speciation_in_the_deep_genomics_and_morphology_reveal_a_new_species_of_beaked_whale_Mesoplodon_eueu

Authors:
Emma L. Carroll, Michael R. McGowen, Morgan L. McCarthy, Felix G. Marx,
Natacha Aguilar, Merel L. Dalebout, Sascha Dreyer, Oscar E. Gaggiotti,
Sabine S. Hansen, Anton van Helden, Aubrie B. Onoufriou, Robin W. Baird, C.
Scott Baker, Simon Berrow, Danielle Cholewiak, Diane Claridge, Rochelle
Constantine, Nicholas J. Davison, Catarina Eira, R. Ewan Fordyce, John
Gatesy, G. J. Greg Hofmeyr, Vidal Martín, James G. Mead, Antonio A.
Mignucci-Giannoni, Phillip A. Morin, Cristel Reyes, Emer Rogan,
Massimiliano Rosso, Mónica A. Silva, Mark S. Springer, Debbie Steel and
Morten Tange Olsen.

Abstract:
The deep sea has been described as the last major ecological frontier, as
much of its biodiversity is yet to be discovered and described. Beaked
whales (ziphiids) are among the most visible inhabitants of the deep sea,
due to their large size and worldwide distribution, and their taxonomic
diversity and much about their natural history remain poorly understood. We
combine genomic and morphometric analyses to reveal a new Southern
Hemisphere ziphiid species, Ramari’s beaked whale, Mesoplodon eueu, whose
name is linked to the Indigenous peoples of the lands from which the
species holotype and paratypes were recovered. Mitogenome and ddRAD-
derived phylogenies demonstrate reciprocally monophy- letic divergence
between M. eueu and True’s beaked whale (M. mirus) from the North Atlantic,
with which it was previously subsumed. Morphometric analyses of skulls also
distinguish the two species. A time-calibrated mitogenome phylogeny and
analysis of two nuclear gen- omes indicate divergence began circa 2 million
years ago (Ma), with geneflow ceasing 0.35–0.55Ma. This is an example of
how deep sea biodiversity can be unravelled through increasing
international collaboration and genome sequencing of archival specimens.
Our consul- tation and involvement with Indigenous peoples offers a model
for broadening the cultural scope of the scientific naming process.

Especiación en las profundidades: la genómica y la morfología revelan una
nueva especie de zifio Mesoplodon eueu
El mar profundo ha sido descrito como la última gran frontera ecológica,
pues gran parte de su biodiversidad aún no ha sido descubierta y descrita.
Los zifios (ziphiidae) se
encuentran entre los habitantes más visibles del océano profundo, debido a
su gran tamaño, distribución mundial diversidad taxonómica y gran parte de
su historia natural sigue siendo poco conocida. Combinamos el análisis
genómico y morfométrico para revelar una nueva especie de zifio en el
hemisferio sur: el zifio de Ramari, Mesoplodon eueu, cuyo nombre está
vinculado a los indígenas de las tierras de las que provienen el holotipo y
los paratipos. La filogenia derivada del mitogenoma y ddRAD demuestran una
divergencia recíproca monofilética entre M. eueu y el zifio de True (M.
mirus) del Atlántico Norte, con el cual fue subsumido previamente. El
análisis morfométrico de los cráneos también distingue las dos especies. La
calibración en el tiempo de la divergencia en la filogenia del mitogenoma y
el análisis de dos genomas nucleares indica que la divergencia comenzó hace
aproximadamente circa 2 millones de años (Ma), cesando el flujo genético
entre 0,35 y 0,55 Ma. Esta investigación es un ejemplo de como se puede
desentrañar la biodiversidad de las profundidades marinas mediante el
aumento de la colaboración internacional y de la secuenciación del genoma
de muestras procedentes de archivo. Nuestra consulta y la participación con
los pueblos indígenas ofrece una modelo que amplia el alcance cultural de
la ciencia en el proceso de la nomenclatura científica.

Especiação nas profundezas: genómica e morfologia revelam uma nova espécie
de baleia-de-bico Mesoplodon eueu
O mar profundo tem sido descrito como a última grande fronteira ecológica,
uma vez que grande parte da sua biodiversidade ainda está por descobrir e
descrever. Devido ao seu tamanho e distribuição global, as baleias-de-bico
(zifídeos) estão entre os habitantes do mar profundo mais conspícuos. Ainda
assim, a diversidade taxonómica e história natural deste grupo permanecem
pouco conhecidas. Neste trabalho, combinámos análises genómicas e
morfométricas para revelar uma nova espécie de zifídeo do Hemisfério Sul, a
baleia-de-bico de Ramari, Mesoplodon eueu, cujo nome está ligado aos povos
indígenas que habitam as regiões onde foram descobertos o holótipo e
parátipo da espécie. Filogenias baseadas no mitogenoma e em ddRAD
demonstram divergência monofilética recíproca entre M. eueu e a
baleia-de-bico de True (M. mirus) do Atlântico Norte, espécie com a qual
havia sido previamente agrupada. Análises morfométricas dos crânios também
distinguiram as duas espécies. Resultados da filogenia do mitogenoma
calibrada temporalmente e da análise de dois genomas nucleares indicam que
a divergência entre as espécies teve início há cerca de 2 milhões de anos
(Ma), e que o fluxo genético cessou há 0.35-0.55 Ma. Este trabalho
constitui um exemplo de como a crescente colaboração internacional e a
sequenciação genómica de espécimes de colecções museológicas podem
contribuir para desvendar a biodiversidade do mar profundo. A consulta e
envolvimento dos povos indígenas no processo de atribuição do nome
científico desta espécie serve também como modelo para o alargamento do
actual espectro cultural do sistema de nomenclatura científica.

cheers
Emma Carroll

Rutherford Discovery Fellow | Senior Research Fellow
Te Kura Mātauranga Koiora | School of Biological Sciences
Waipapa Taumata Rau | University of Auckland
e: e.carroll at auckland.ac.nz | p: +64 9 923 8239 | t: @EmzLCarroll
w: www.tohoravoyages.ac.nz
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